Aðalfundur Samfés er æðsta vald í málefnum samtakanna og er haldinn ár hvert fyrir lok aprílmánaðar. Þar koma saman fulltrúar aðildarfélaga Samfés – félagsmiðstöðva og ungmennahúsa um land allt – til að fara yfir starfsemi samtakanna, leggja fram skýrslur stjórnar og nefnda, fjalla um ársreikninga, samþykkja árgjöld og lagabreytingar, kjósa í stjórn og nefndir, og ræða framtíðarstefnu Samfés.

Á aðalfundi er einnig tekið á móti nýjum aðildarfélögum og rætt um þróun og faglegar áherslur innan frístundastarfs á landsvísu. Fundurinn er því mikilvægur vettvangur lýðræðis, samráðs og faglegrar stefnumótunar á sviði æskulýðs- og tómstundamála.